Five eIF4E isoforms from Arabidopsis thaliana are characterized by distinct features of cap analogs binding
PBN-AR
Instytucja
Wydział Fizyki (Uniwersytet Warszawski)
Źródłowe zdarzenia ewaluacyjne
Informacje podstawowe
Główny język publikacji
en
Czasopismo
BIOCHEMICAL AND BIOPHYSICAL RESEARCH COMMUNICATIONS
ISSN
0006-291X
EISSN
1090-2104
Wydawca
ACADEMIC PRESS INC ELSEVIER SCIENCE
DOI
URL
Rok publikacji
2015
Numer zeszytu
1
Strony od-do
47-52
Numer tomu
456
Link do pełnego tekstu
Identyfikator DOI
Liczba arkuszy
Słowa kluczowe
en
eIF4E Cap analog Binding affinity Fluorescence titration Homology modeling
Streszczenia
Język
en
Treść
Abstract The assembly of the ribosome on majority of eukaryotic mRNAs is initiated by the recruitment of eIF4E protein to the mRNA 5′ end cap structure. Flowering plants use two eIF4E isoforms, named eIF4E and eIF(iso)4E, as canonical translation initiation factors and possess a homolog of mammalian 4EHP (or eIF4E-2) termed nCBP. Plants from Brassicaceae family additionally conserve a close paralog of eIF4E which in Arabidopsis thaliana has two copies named eIF4E1b and eIF4E1c. In order to assess the efficiency of plant non-canonical (eIF4E1b/1c and nCBP) and canonical (eIF4E and eIF(iso)4E) eIF4E proteins to bind mRNAs we utilized fluorescence titrations to determine accurate binding affinities of five A. thaliana eIF4E isoforms for a series of cap analogs. We found that eIF4E binds cap analogs from 4-fold to 10-fold stronger than eIF(iso)4E, while binding affinities of nCBP and eIF(iso)4E are comparable. Furthermore, eIF4E1c interacts similarly strongly with the cap as eIF4E, but eIF4E1b binds cap analogs ca. 2-fold weaker than eIF4E1c, regardless of the 95% sequence identity between these two proteins. The use of differentially chemically modified cap analogs in binding studies and a detailed analysis of the obtained homology models gave us insight into the molecular characteristic of varying cap-binding abilities of Arabidopsis eIF4E isoforms.
Cechy publikacji
discipline:Biofizyka – dziedzina nauk fizycznych
discipline:Biophysics – field of physical sciences
Original article
Original article presents the results of original research or experiment.
Oryginalny artykuł naukowy
Oryginalny artykuł naukowy przedstawia rezultaty oryginalnych badań naukowych lub eksperymentu.
Inne
System-identifier
PBN-R:603865
CrossrefMetadata from Crossref logo
Cytowania
Liczba prac cytujących tę pracę
Brak danych
Referencje
Liczba prac cytowanych przez tę pracę
Brak danych