Structure-activity relationship study of tetrapeptide inhibitors of the Vascular Endothelial Growth Factor A binding to Neuropilin-1
PBN-AR
Instytucja
Instytut Medycyny Doświadczalnej i Klinicznej im. Mirosława Mossakowskiego Polskiej Akademii Nauk
Źródłowe zdarzenia ewaluacyjne
Informacje podstawowe
Główny język publikacji
en
Czasopismo
PEPTIDES (25pkt w roku publikacji)
ISSN
0196-9781
EISSN
Wydawca
ELSEVIER SCIENCE INC
DOI
URL
Rok publikacji
2017
Numer zeszytu
Strony od-do
25-32
Numer tomu
94
Identyfikator DOI
Liczba arkuszy
1.19
Słowa kluczowe
en
Angiogenesis
Neuropilin-1
VEGF(165)/NRP-1 inhibitors
Conformational flexibility
Molecular dynamics
Streszczenia
Język
en
Treść
Neuropilin-1 is considered as one of the key receptors responsible for signaling pathways involved in pathological angiogenesis necessary for tumor progression, therefore targeting of VEGF(165) binding to NRP-1 could be a relevant strategy for antiangiogenic treatment. It was shown before that the VEGF(165)/NRP-1 interaction can be inhibited by short tetrapeptides with K/RXXR sequence. Here, we present a structure-activity relationship study of the systematic optimization of amino acid residues in positions 1-3 in the above tetrapeptides. All the 13 synthesized analogs possessed C-terminal arginine that is a necessary element for interaction with NRP-1. The obtained results of the inhibitory activity and modeling by molecular dynamics indicate that simultaneous interactions of the basic amino acid residues in position 1 and 4 (Arg) with Neuropilin-1 are crucial and their cooperation strongly affects the inhibitory activity. In addition, the binding strength is modulated by the flexibility of the peptide backbone (in the central part of the peptide), and the nature of the side chain of the amino acids at the second or third position. A dramatic decrease in the activity to the receptor is observed in flexible derivatives that are missing proline residues. The results described in this paper should prove useful for future studies aimed at establishing the best pharmacophore for inhibitors of VEGF(165) binding to NRP-1.
Cechy publikacji
discipline:Biologia medyczna
discipline:Medycyna
discipline:Medical biology
discipline:Medicine
Original article
Original article presents the results of original research or experiment.
Oryginalny artykuł naukowy
Oryginalny artykuł naukowy przedstawia rezultaty oryginalnych badań naukowych lub eksperymentu.
Inne
System-identifier
PBN-R:828223
CrossrefMetadata from Crossref logo
Cytowania
Liczba prac cytujących tę pracę
Brak danych
Referencje
Liczba prac cytowanych przez tę pracę
Brak danych