Amino-Functionalized 5′ Cap Analogs as Tools for Site-Specific Sequence-Independent Labeling of mRNA
PBN-AR
Instytucja
Wydział Fizyki (Uniwersytet Warszawski)
Źródłowe zdarzenia ewaluacyjne
Informacje podstawowe
Główny język publikacji
en
Czasopismo
BIOCONJUGATE CHEMISTRY (40pkt w roku publikacji)
ISSN
1043-1802
EISSN
1520-4812
Wydawca
AMER CHEMICAL SOC
DOI
URL
Rok publikacji
2017
Numer zeszytu
7
Strony od-do
1978-1992
Numer tomu
28
Liczba arkuszy
Streszczenia
Język
en
Treść
mRNA is a template for protein biosynthesis, and consequently mRNA transport, translation, and turnover are key elements in the overall regulation of gene expression. Along with growing interest in the mechanisms regulating mRNA decay and localization, there is an increasing need for tools enabling convenient fluorescent labeling or affinity tagging of mRNA. We report new mRNA 5′ cap analog-based tools that enable site-specific labeling of RNA within the cap using N-hydroxysuccinimide (NHS) chemistry. We explored two complementary methods: a co-transcriptional labeling method, in which the label is first attached to a cap analog and then incorporated into RNA by in vitro transcription, and a post-transcriptional labeling method, in which an amino-functionalized cap analog is incorporated into RNA followed by chemical labeling of the resulting transcript. After testing the biochemical properties of RNAs carrying the novel modified cap structures, we demonstrated the utility of fluorescently labeled RNAs in decapping assays, RNA decay assays, and RNA visualization in cells. Finally, we also demonstrated that mRNAs labeled by the reported method are translationally active. We envisage that the novel analogs will provide an alternative to radiolabeling of mRNA caps for in vitro studies and open possibilities for new applications related to the study of mRNA fates in vivo.
Cechy publikacji
Original article
Original article presents the results of original research or experiment.
Oryginalny artykuł naukowy
Oryginalny artykuł naukowy przedstawia rezultaty oryginalnych badań naukowych lub eksperymentu.
Inne
System-identifier
PBN-R:829466
CrossrefMetadata from Crossref logo
Cytowania
Liczba prac cytujących tę pracę
Brak danych
Referencje
Liczba prac cytowanych przez tę pracę
Brak danych