Cross Species Amplification of Coat Colour Genes in Nutria (Myocastor coypus Mol)
PBN-AR
Instytucja
Wydział Hodowli i Biologii Zwierząt (Uniwersytet Rolniczy im. Hugona Kołłątaja w Krakowie)
Źródłowe zdarzenia ewaluacyjne
Informacje podstawowe
Główny język publikacji
en
Czasopismo
Folia Biologica-Krakow
ISSN
0015-5497
EISSN
Wydawca
DOI
URL
Rok publikacji
2016
Numer zeszytu
2
Strony od-do
105-111
Numer tomu
64
Identyfikator DOI
Liczba arkuszy
0.5
Słowa kluczowe
en
nutria, cross-species, amplification, coat colour
Streszczenia
Język
en
Treść
In this study, nutria-specific DNA fragments were amplified with cross-species primers for parts of coat colour genes (MC1R, ASIP, TYRP-1, c-KIT) conserved across a number of species. Twenty-three nutria-specific DNA fragments were generated using cross-species PCR (26.7% amplification success rate). Certain limitations of this approach were encountered, including strong mismatching in the primer binding sites. Sequences of 12 nutria-specific PCR products aligned in the BLASTx option showed homology with known protein sequences. Obtained sequences were submitted to GenBank with accession number KC758969 for MC1R, KF511655 for ASIP, KF511656 for TYPR-1 and KU831489 for c-KIT. The highest homology for all translated queries was obtained with protein sequences belonging to species of the rodent family. Sequences of proteins encoded by genes involved in environmental adaptation (coat colour genes in rodents) were found to be strongly conserved among species.
Inne
System-identifier
UR2910d8bf0cf24b7d87127fc9e7f7acfa
CrossrefMetadata from Crossref logo
Cytowania
Liczba prac cytujących tę pracę
Brak danych
Referencje
Liczba prac cytowanych przez tę pracę
Brak danych