Diversity of Trichoderma spp. causing Pleurotus green mould diseases in Central Europe
PBN-AR
Instytucja
Wydział Ogrodnictwa i Architektury Krajobrazu (Uniwersytet Przyrodniczy w Poznaniu)
Informacje podstawowe
Główny język publikacji
en
Czasopismo
Folia Microbiologica
ISSN
0015-5632
EISSN
1874-9356
Wydawca
SPRINGER
DOI
URL
Rok publikacji
2013
Numer zeszytu
4
Strony od-do
325-333
Numer tomu
58
Identyfikator DOI
Liczba arkuszy
Autorzy
Pozostali autorzy
+ 1
Słowa kluczowe
en
Pleurotus ostreatus
green mould
Trichoderma pleurotum
Trichoderma pleuroticola
molecular characteristics
Open access
Tryb otwartego dostępu
Otwarte czasopismo
Wersja tekstu w otwartym dostępie
Wersja opublikowana
Licencja otwartego dostępu
Inna
Czas opublikowania w otwartym dostępie
Razem z publikacją
Data udostępnienia w sposób otwarty
Streszczenia
Język
en
Treść
The present study includes the molecular characteristics of Trichoderma pleurotum and Trichoderma pleuroticola isolates collected from green moulded cereal straw substrates at 47 oyster mushroom farms in Poland. The screening of the 80 Trichoderma isolates was performed by morphological observation and by using the multiplex PCR assay. This approach enabled specific detection of 47 strains of T. pleurotum and 2 strains of T. pleuroticola. Initial identifications were confirmed by sequencing the fragment of internal transcribed spacer regions 1 and 2 (ITS1 and ITS2) of the rRNA gene cluster and the fragment including the fourth and fifth introns and the last long exon of the translation–elongation factor 1-alpha (tef1) gene. ITS and tef1 sequence information was also used to establish the intra- and interspecies relationship of T. pleurotum and T. pleuroticola originating from the oyster mushroom farms in Poland and from other countries. Comparative analysis of the ITS sequences showed that all T. pleurotum isolates from Poland represent one haplotype, identical to that of T. pleurotum strains from Hungary and Romania. Sequence analysis of the tef1 locus revealed two haplotypes (“T” and “N”)of Polish T. pleurotum isolates. The “T” type isolates of T. pleurotum were identical to those of strains from Hungary and Romania. The“N” type isolates possessed a unique tef1 allele. Detailed analysis of the ITS and tef1 sequences of two T. pleuroticola isolates showed their identicalness to Italian strain C.P.K. 1540.
Inne
System-identifier
0000005724
CrossrefMetadata from Crossref logo
Cytowania
Liczba prac cytujących tę pracę
Brak danych
Referencje
Liczba prac cytowanych przez tę pracę
Brak danych