Watson-Crick-like pairs in CCUG repeats: evidence for tautomeric shifts or protonation
PBN-AR
Instytucja
Instytut Chemii Bioorganicznej Polskiej Akademii Nauk
Informacje podstawowe
Główny język publikacji
en
Czasopismo
RNA
ISSN
1355-8382
EISSN
Wydawca
DOI
URL
Rok publikacji
2016
Numer zeszytu
1
Strony od-do
22-31
Numer tomu
22
Identyfikator DOI
Liczba arkuszy
Słowa kluczowe
en
CCUG repeats
myotonic dystrophy type 2
X-ray crystallography
thermodynamics
tautomerism
Open access
Tryb otwartego dostępu
Inne
Wersja tekstu w otwartym dostępie
Wersja opublikowana
Licencja otwartego dostępu
Creative Commons — Uznanie autorstwa-Niekomercyjne
Czas opublikowania w otwartym dostępie
Razem z publikacją
Streszczenia
Język
en
Treść
RNA transcripts that include expanded CCUG repeats are associated with myotonic dystrophy type 2. Crystal structures of two CCUG-containing oligomers show that the RNA strands associate into slipped duplexes that contain noncanonical C-U pairs that have apparently undergone tautomeric transition or protonation resulting in an unusual Watson Crick-like pairing. The overhanging ends of the duplexes interact forming U-U pairs, which also show tautomerism. Duplexes consisting of CCUG repeats are thermodynamically less stable than the trinucleotide repeats involved in the TRED genetic disorders, but introducing LNA residues increases their stability and raises the melting temperature of the studied oligomers by similar to 10 degrees C, allowing detailed crystallographic studies. Quantum mechanical calculations were performed to test the possibility of the tautomeric transitions or protonation within the noncanonical pairs. The results indicate that tautomeric or ionic shifts of nucleobases can manifest themselves in biological systems, supplementing the canonical "rules of engagement."
Inne
System-identifier
PX-56cec7332cdc5c33fd0ce94f
CrossrefMetadata from Crossref logo
Cytowania
Liczba prac cytujących tę pracę
Brak danych
Referencje
Liczba prac cytowanych przez tę pracę
Brak danych