The Molecular Characterization of Bovine Leukaemia Virus Isolates from Eastern Europe and Siberia and Its Impact on Phylogeny
PBN-AR
Instytucja
Państwowy Instytut Weterynaryjny - Państwowy Instytut Badawczy
Informacje podstawowe
Główny język publikacji
en
Czasopismo
PLoS One
ISSN
1932-6203
EISSN
Wydawca
PUBLIC LIBRARY SCIENCE
DOI
URL
Rok publikacji
2013
Numer zeszytu
3
Strony od-do
e58705
Numer tomu
8
Identyfikator DOI
Liczba arkuszy
Autorzy
Pozostali autorzy
+ 5
Słowa kluczowe
en
bovine leukaemia virus
Eastern Europe
Siberia
Phylogenetic analysis
Molecular Charakterization
Open access
Tryb otwartego dostępu
Otwarte czasopismo
Wersja tekstu w otwartym dostępie
Wersja ostateczna autora
Licencja otwartego dostępu
Creative Commons — Uznanie autorstwa
Czas opublikowania w otwartym dostępie
Razem z publikacją
Data udostępnienia w sposób otwarty
Streszczenia
Język
en
Treść
Recent studies have shown that bovine leukemia virus (BLV) sequences can be classified into seven distinct genotypes based on full gp51 sequence. This classification was based on available sequence data that mainly represented the BLV population that is circulating in cattle from the US and South America. In order to aid with a global perspective inclusion of data from Eastern Europe is required. In this study we examined 44 BLV isolates from different geographical regions of Poland, Belarus, Ukraine, and Russia. Phylogenetic analysis based on a 444bp fragment of env gene revealed that most of isolates belonged to genotypes 4 and 7. Furthermore, we confirmed the existence of a new genotype, genotype 8, which was highly supported by phylogenetic computations. A significant number of amino acid substitutions were found in the sequences of the studied Eastern European isolates, of which 71% have not been described previously. The substitutions encompassed mainly the C-part of the CD4+ epitope, zinc binding peptide region, CD8+ T cell epitope, and overlapping linear epitope E. These observations highlight the use of sequence data to both elucidate phylogenetic relationships and the potential effect on serological detection of geographically diverse isolates.
Cechy publikacji
ORIGINAL_ARTICLE
Inne
System-identifier
552466
CrossrefMetadata from Crossref logo
Cytowania
Liczba prac cytujących tę pracę
Brak danych
Referencje
Liczba prac cytowanych przez tę pracę
Brak danych