In-house validation of PCR based procedure for specific detection of Clostridium botulinum types C and D
PBN-AR
Instytucja
Państwowy Instytut Weterynaryjny - Państwowy Instytut Badawczy
Informacje podstawowe
Główny język publikacji
en
Czasopismo
Bulletin of the Veterinary Institute in Pulawy
ISSN
0042-4870
EISSN
2300-3235
Wydawca
Państwowy Instytut Weterynaryjny - PIB
DOI
Rok publikacji
2014
Numer zeszytu
3
Strony od-do
393-398
Numer tomu
58
Identyfikator DOI
Liczba arkuszy
Słowa kluczowe
en
Clostridium botulinum
C and D toxins
feed
silage
validation
Open access
Tryb otwartego dostępu
Otwarte czasopismo
Wersja tekstu w otwartym dostępie
Wersja opublikowana
Licencja otwartego dostępu
Creative Commons — Uznanie autorstwa-Niekomercyjne-Bez utworów zależnych
Czas opublikowania w otwartym dostępie
Razem z publikacją
Streszczenia
Język
en
Treść
A PCR-based procedure for detection of C. botulinum C and D in corn silage samples was validated. During the validation, method specificity, sensitivity, and accuracy were determined according to PN – EN ISO 16140:2004. Additionally, the specificity of the validated methods was proved by sequence analysis of PCR products obtained from examination of samples connected with botulism cases in cattle and mallard ducks. Limit of detection was estimated according to the Spearman – Kärber formula and expressed as LOD50. The obtained results showed that a 100% specificity was achieved. The sequencing of PCR products revealed 99% identity with sequences of bont/C and bont/D genes deposited in the GenBank. The sensitivity value ranged from 63.3% for C. botulinum type C to 75% for type D. The accuracy value varied from 72% for type C to 81.3% for type D. LOD50 was estimated at the levels of 0.272 (0. D 188-0395) spore/g for type C and 0.17 (0.1-0.289) spore/g for type D. The described PCR-based procedure enabled detection of C. botulinum C and D at the stage of liquid culture. This makes examination of feed samples possible without isolation process. The presented procedure could support the diagnosis of botulism by faster and specific laboratory examination process.
Cechy publikacji
praca doświadczalna
Inne
System-identifier
553983
CrossrefMetadata from Crossref logo
Cytowania
Liczba prac cytujących tę pracę
Brak danych
Referencje
Liczba prac cytowanych przez tę pracę
Brak danych