Application of SYBR Green I and TaqMan probe-based real-time PCRs for the identification of Listeria spp. and Listeria monocytogenes
PBN-AR
Instytucja
Państwowy Instytut Weterynaryjny - Państwowy Instytut Badawczy
Informacje podstawowe
Główny język publikacji
en
Czasopismo
Bulletin of the Veterinary Institute in Pulawy
ISSN
0042-4870
EISSN
2300-3235
Wydawca
Państwowy Instytut Weterynaryjny - PIB
DOI
Rok publikacji
2015
Numer zeszytu
4
Strony od-do
489-494
Numer tomu
59
Identyfikator DOI
Liczba arkuszy
Słowa kluczowe
en
Listeria monocytogenes;
real-time PCR
SYBR Green I
TaqMan probe
Open access
Tryb otwartego dostępu
Otwarte czasopismo
Wersja tekstu w otwartym dostępie
Wersja opublikowana
Licencja otwartego dostępu
Creative Commons — Uznanie autorstwa-Niekomercyjne-Bez utworów zależnych
Czas opublikowania w otwartym dostępie
Razem z publikacją
Streszczenia
Język
en
Treść
The aim of the study was the application and comparison of real-time PCR methods based on the fluorescence of SYBR Green I intercalating dye and TaqMan probes for the detection of the 23S rDNA gene of Listeria spp. and the hlyA gene of Listeria monocytogenes. Five strains of L. monocytogenes and single strains of each of the species: L. ivanovii, L. innocua, L. grayi, L. welshimeri, and L. seeligeri were used for the experiments. Additionally, five strains of other species of bacteria were used for evaluation of the specificity of the tests. QuantiTect SYBR Green PCR and QuantiTect Probe PCR kits were selected for the study. In the first stage of the study, SYBR Green I real-time PCRs were performed under several methods, the first one allowing detection of the 23S rDNA gene and the remainder based on the amplification of the hlyA gene. In the next part, three varied in method TaqMan probe-based real-time PCRs allowing confirmation of strains belonging to Listeria spp. and L. monocytogenes were conducted. The observation of amplification curves in real-time PCR methods enabled the detection of both genes, and these methods demonstrated a significant sensitivity and high specificity. A high regression coefficient of 0.99 was found for all reactions. Specific amplification products were obtained for the 23S rDNA and hlyA genes, which confirmed the tested strains as Listeria spp. and L. monocytogenes respectively. Isolates of other microbial species did not yield real-time PCR products.
Cechy publikacji
ORIGINAL_ARTICLE
Inne
System-identifier
704278
CrossrefMetadata from Crossref logo
Cytowania
Liczba prac cytujących tę pracę
Brak danych
Referencje
Liczba prac cytowanych przez tę pracę
Brak danych