Cumulative effect of IFIH1 variants and increased gene expression associated with type 1 diabetes.
PBN-AR
Instytucja
Instytut Genetyki Człowieka Polskiej Akademii Nauk
Informacje podstawowe
Główny język publikacji
angielski
Czasopismo
DIABETES RESEARCH AND CLINICAL PRACTICE
ISSN
0168-8227
EISSN
Wydawca
ELSEVIER IRELAND LTD
DOI
URL
Rok publikacji
2015
Numer zeszytu
2
Strony od-do
259-266
Numer tomu
107
Identyfikator DOI
Liczba arkuszy
1
Słowa kluczowe
ang.
T1D
IFIH1
variants
gene expression
cumulative effect of variants
Open access
Tryb otwartego dostępu
Inne
Wersja tekstu w otwartym dostępie
Wersja opublikowana
Licencja otwartego dostępu
Inna
Czas opublikowania w otwartym dostępie
Po publikacji
Ilość miesięcy od publikacji
2
Data udostępnienia w sposób otwarty
Streszczenia
Język
angielski
Treść
AIMS: IFIH1 (Interferon Induced with Helicase C domain 1) gene encodes a sensor of double-stranded RNA, which initiates antiviral activity. Recent studies have indicated the association of rare and common IFIH1 variants with type 1 diabetes mellitus (T1D). The aim of this study was to investigate whether polymorphisms in the IFIH1 locus are a risk factor for T1D in Caucasian patients from Poland. METHODS: We genotyped 514 T1D patients and 713 healthy control individuals for rs3747517, rs1990760, rs2111485 and rs13422767 variants. Cumulative genetic risk score (CGRS) was calculated using unweighted and weighted approaches. We also examined the expression of IFIH1 gene in a cohort of 90 T1D patients. RESULTS: All studied polymorphisms showed significant association with type 1 diabetes. The risk alleles G of rs3747517, rs2111485, rs13422767 and A of rs1990760 were observed more frequently in T1D group with P values and allelic odds ratio OR (95%CI) < 0.0001, 1.742 (1.428-2.126); 0.001, 1.336 (1.125-1.588); < 0.0001, 1.799 (1.416-2.285); 0.0005, 1.359 (1.144-1.616), respectively. The risk for type 1 diabetes increased with the growing number of the risk alleles. OR (95%CI) for carriers of ≥ 6 risk alleles reached 2.387 (1.552-3.670) for unweighted CGRS and 3.132 (1.928-5.089) for weighted CGRS. Furthermore, IFIH1 gene expression levels in unstimulated peripheral blood mononuclear cells of T1D patients were significantly higher compared to healthy individuals (mean ± SEM mRNA copy number 163.8 ± 15.7 vs. 117.8 ± 7.2; P = 0.046). CONCLUSIONS: This study confirms the association of the IFIH1 locus with susceptibility to T1D in the Polish population. The cumulative effect of rs3747517, rs1990760, rs2111485 and rs13422767 variants on type 1 diabetes risk was observed.
Cechy publikacji
Oryginalna
Inne
System-identifier
PX-57abce61c2dc0a5149c327a4
CrossrefMetadata from Crossref logo
Cytowania
Liczba prac cytujących tę pracę
Brak danych
Referencje
Liczba prac cytowanych przez tę pracę
Brak danych