A single nucleotide polymorphism -35 kb T>C (rs9264942) is strongly associated with psoriasis vulgaris depending on HLA-Cw(∗)06
PBN-AR
Instytucja
Instytut Immunologii i Terapii Doświadczalnej im. Ludwika Hirszfelda Polskiej Akademii Nauk
Informacje podstawowe
Główny język publikacji
EN
Czasopismo
Human immunology
ISSN
0198-8859
EISSN
1879-1166
Wydawca
[New York] Elsevier/North-Holland
Rok publikacji
2014
Numer zeszytu
6
Strony od-do
504-507
Numer tomu
75
Identyfikator DOI
Liczba arkuszy
Autorzy przekładu
(liczba autorów przekładu: 0)
Słowa kluczowe
EN
Psoriasis vulgaris
HLA-C
rs9264942
Susceptibility
Genetics
Streszczenia
Język
EN
Treść
HLA class I molecules play a role both in viral infection control and in autoimmune diseases development. rs9264942T > C polymorphism in HLA-C gene was found to impact on HLA-C surface expression level and to be associated with HIV-1 control. It was found that these HLA alleles which protect against AIDS are associated with autoimmune disease e.g. psoriasis vulgaris (PsV). Whether rs9264942 SNP is associated with PsV was investigated here. rs9264942T > C was genotyped in 292 PsV patients, and 254 controls using TaqMan Genotyping Assay. PsV patients differed from controls in frequencies of rs9264942T > C alleles (p = 3.62 × 10−16) and genotypes (5.67 × 10−15). However, rs9264942C allele was predisposing to PsV 3-fold weaker than HLA-Cw∗06 (OR = 5.04 vs. OR = 15.61, respectively). In addition, this SNP was described earlier to be in strong linkage disequilibrium (LD) with another SNP, rs67384697 ins/del, which by affecting a microRNA binding is responsible for regulating HLA-C expression. However, typing for is cheaper and simpler than that for rs67384697, therefore we think it may substitute for it to some extent.
Cechy publikacji
artykuł oryginalny
Inne
System-identifier
PX-56b48bca8106eb71826f8177
CrossrefMetadata from Crossref logo
Cytowania
Liczba prac cytujących tę pracę
Brak danych
Referencje
Liczba prac cytowanych przez tę pracę
Brak danych