Detection of ureolytic activity of bacterial strains isolated from entomopathogenic nematodes using infrared spectroscopy
PBN-AR
Instytucja
Instytut Immunologii i Terapii Doświadczalnej im. Ludwika Hirszfelda Polskiej Akademii Nauk
Informacje podstawowe
Główny język publikacji
angielski
Czasopismo
JOURNAL OF BASIC MICROBIOLOGY
ISSN
0233-111X
EISSN
1521-4028
Wydawca
WILEY-BLACKWELL
DOI
URL
Rok publikacji
2016
Numer zeszytu
8
Strony od-do
922-928
Numer tomu
56
Identyfikator DOI
Liczba arkuszy
Autorzy
Pozostali autorzy
+ 6
Słowa kluczowe
angielski
Urease
Infrared spectroscopy
Pseudomonas
Streszczenia
Język
angielski
Treść
The pathogenicity of entomopathogenic nematodes (EPNs) depends directly on the presence of bacteria in the nematode digestive tracts. Based on 16S rRNA and MALDI-TOF analyses 20 isolated bacteria were assigned to 10 species with 10 isolates classified as Pseudomonas ssp. Six strains (30%) show ureolytic activity on Christensen medium. Spectroscopic analysis of the strains showed that the ureolytic activity is strongly correlated with the following wavenumbers: 935 cm(-1) in window W4, which carries information about the bacterial cell wall construction and 1158 cm(-1) in window W3 which corresponds to proteins in bacterial cell. A logistic regression model designed on the basis of the selected wavenumbers differentiates ureolytic from non-ureolytic bacterial strains with an accuracy of 100%. Spectroscopic studies and mathematical analyses made it possible to differentiate EPN-associated Pseudomonas sp. strains from clinical Pseudomonas aeruginosa PAO1. These results suggest, that infrared spectra of EPN-associated Pseudomonas sp. strains may reflect its adaptation to the host.
Cechy publikacji
artykuł
Inne
System-identifier
PX-58a1b5a9d5deb89f5f8acbff
CrossrefMetadata from Crossref logo
Cytowania
Liczba prac cytujących tę pracę
Brak danych
Referencje
Liczba prac cytowanych przez tę pracę
Brak danych