Genome-wide co-localization of active EGFR and downstream ERK pathway kinases mirrors mitogen-inducible RNA polymerase 2 genomic occupancy.
PBN-AR
Instytucja
Międzynarodowy Instytut Biologii Molekularnej i Komórkowej w Warszawie
Informacje podstawowe
Główny język publikacji
angielski
Czasopismo
NUCLEIC ACIDS RESEARCH
ISSN
0305-1048
EISSN
1362-4962
Wydawca
OXFORD UNIV PRESS
DOI
URL
Rok publikacji
2016
Numer zeszytu
21
Strony od-do
10150-10164
Numer tomu
44
Identyfikator DOI
Liczba arkuszy
0,66
Autorzy
Pozostali autorzy
+ 15
Autorzy przekładu
(liczba autorów przekładu: 0)
Słowa kluczowe
angielski
chromatin
endosomes
genes
genome
growth factor
mitogens
phosphotransferases
receptor
epidermal growth factor
extracellular matrix-cell signaling
Open access
Tryb otwartego dostępu
Inne
Wersja tekstu w otwartym dostępie
Wersja opublikowana
Licencja otwartego dostępu
Creative Commons — Uznanie autorstwa
Czas opublikowania w otwartym dostępie
Przed publikacją
Streszczenia
Język
angielski
Treść
Genome-wide mechanisms that coordinate expression of subsets of functionally related genes are largely unknown. Recent studies show that receptor tyrosine kinases and components of signal transduction cascades including the extracellular signal-regulated protein kinase (ERK), once thought to act predominantly in the vicinity of plasma membrane and in the cytoplasm, can be recruited to chromatin encompassing transcribed genes. Genome-wide distribution of these transducers and their relationship to transcribing RNA polymerase II (Pol2) could provide new insights about co-regulation of functionally related gene subsets. Chromatin immunoprecipitations (ChIP) followed by deep sequencing, ChIP-Seq, revealed that genome-wide binding of epidermal growth factor receptor, EGFR and ERK pathway components at EGF-responsive genes was highly correlated with characteristic mitogen-induced Pol2-profile. Endosomes play a role in intracellular trafficking of proteins including their nuclear import. Immunofluorescence revealed that EGF-activated EGFR, MEK1/2 and ERK1/2 co-localize on endosomes. Perturbation of endosome internalization process, through the depletion of AP2M1 protein, resulted in decreased number of the EGFR containing endosomes and inhibition of Pol2, EGFR/ERK recruitment to EGR1 gene. Thus, mitogen-induced co-recruitment of EGFR/ERK components to subsets of genes, a kinase module possibly pre-assembled on endosome to synchronize their nuclear import, could coordinate genome-wide transcriptional events to ensure effective cell proliferation.
Cechy publikacji
artykuł naukowy
Inne
System-identifier
PX-5897796a82ce8f785650e67d
CrossrefMetadata from Crossref logo
Cytowania
Liczba prac cytujących tę pracę
Brak danych
Referencje
Liczba prac cytowanych przez tę pracę
Brak danych