Characteristics of runs of homozygosity in selected cattle breeds maintained in Poland
PBN-AR
Instytucja
Instytut Zootechniki - Państwowy Instytut Badawczy
Informacje podstawowe
Główny język publikacji
EN
Czasopismo
Livestock Science
ISSN
1871-1413
EISSN
1878-0490
Wydawca
ELSEVIER
DOI
Rok publikacji
2016
Numer zeszytu
Strony od-do
72-80
Numer tomu
188
Identyfikator DOI
Liczba arkuszy
0.82
Słowa kluczowe
EN
Runs of homozygosity
EN
Autozygosity
EN
Selection signatures
Open access
Tryb otwartego dostępu
Inne
Wersja tekstu w otwartym dostępie
Wersja opublikowana
Licencja otwartego dostępu
Inna
Czas opublikowania w otwartym dostępie
Razem z publikacją
Data udostępnienia w sposób otwarty
Streszczenia
Język
EN
Treść
Runs of homozygosity (ROH) are defined as contiguous homozygous regions of the genome where the two haplotypes inherited from the parents are identical. It has been shown that the length and frequency of ROH may describe the history of the population in which an individual occurs; they may also reveal the level of inbreeding within populations, recent population bottlenecks or signatures of positive selection. In this study, BovineSNP50 whole-genome genotyping assay was used to analyse the lengths and distributions of the ROH found in the genomes of four cattle breeds maintained in Poland (Holstein, Polish Red, Limousin and Simmental) to assess both the level of autozygosity of each breed and to identify the genomic regions most commonly associated with ROH that may reflect directional selection pressure. Visible differences in the length and distribution of homozygous regions across the genome between selected breeds were observed. The breeds also varied in the level of autozygosity (inbreeding) estimated by FROH, which was lower for unselected cattle. Moreover, within the regions of the genome most commonly associated with ROH that may reveal signatures of recent selection a number of genes potentially connected with different production features characteristic for individual breeds were detected
Cechy publikacji
Oryginalny-artykuł-naukowy
Inne
System-identifier
5956
CrossrefMetadata from Crossref logo
Cytowania
Liczba prac cytujących tę pracę
Brak danych
Referencje
Liczba prac cytowanych przez tę pracę
Brak danych