Cost-effective screening of DNMT3A coding sequence identifies somatic mutation in pediatric T-cell acute lymphoblastic leukemia.
PBN-AR
Instytucja
Instytut Genetyki Człowieka Polskiej Akademii Nauk
Informacje podstawowe
Główny język publikacji
angielski
Czasopismo
European Journal of Haematology (25pkt w roku publikacji)
ISSN
0902-4441
EISSN
1600-0609
Wydawca
WILEY-BLACKWELL
DOI
URL
Rok publikacji
2017
Numer zeszytu
6
Strony od-do
514-519
Numer tomu
99
Identyfikator DOI
Liczba arkuszy
0,8
Słowa kluczowe
angielski
DNMT3A
high-resolution melt
mutation screening
pediatric T-cell acute lymphoblastic leukemia
prognostic factors
Open access
Tryb otwartego dostępu
Otwarte czasopismo
Wersja tekstu w otwartym dostępie
Wersja opublikowana
Licencja otwartego dostępu
Inna
Czas opublikowania w otwartym dostępie
Przed publikacją
Data udostępnienia w sposób otwarty
Streszczenia
Język
angielski
Treść
Abstract BACKGROUND AND OBJECTIVES: In pediatric T-cell acute lymphoblastic leukemia (T-ALL), risk assignment schemes preclude reliable prediction of outcome, and thus, new prognostic factors are needed. Mutations in DNMT3A are candidate prognostic and classification markers in adults with acute myeloid leukemia (AML) and T-ALL and thus were considered as candidates prognostic markers in pediatric T-ALL. PATIENTS AND METHODS: DNMT3A mutational status was investigated in 74 pediatric T-ALL samples collected at diagnosis. We applied high-resolution melt (HRM) analysis and Sanger sequencing to study the hotspot position (R882) within catalytic MTase domain and exons coding for other functional domains of the protein, known to be mutated in the wide spectrum of hematological malignancies. RESULTS: We demonstrate a low frequency of mutations in DNMT3A coding sequence in pediatric T-ALL (1.4%, n = 1/74). We identified missense mutation, p.Ala644Thr, which has not been described previously in pediatric T-ALL, but is recurrent in adults with T-ALL and AML. CONCLUSIONS: Low frequency of DNMT3A mutations in pediatric T-ALL is in striking contrast to adult T-ALL and renders the necessity for the search of other candidate prognostic markers. Combined Sanger sequencing-HRM approach offers a cost-effective option for genotyping DNMT3A coding sequence, with potential clinical application in other hematological malignancies.
Cechy publikacji
oryginalna
Inne
System-identifier
PX-5a1bddbdd5de651c2eef34b5
CrossrefMetadata from Crossref logo
Cytowania
Liczba prac cytujących tę pracę
Brak danych
Referencje
Liczba prac cytowanych przez tę pracę
Brak danych