Haplotype dependent association of rs7927894 (11q13.5) with atopic dermatitis and chronic allergic rhinitis: A study in ECAP cohort.
PBN-AR
Instytucja
Instytut Immunologii i Terapii Doświadczalnej im. Ludwika Hirszfelda Polskiej Akademii Nauk
Informacje podstawowe
Główny język publikacji
angielski
Czasopismo
PLoS One (40pkt w roku publikacji)
ISSN
EISSN
1932-6203
Wydawca
PUBLIC LIBRARY SCIENCE
DOI
URL
Rok publikacji
2017
Numer zeszytu
9
Strony od-do
e0183922
Numer tomu
12
Identyfikator DOI
Liczba arkuszy
Open access
Tryb otwartego dostępu
Otwarte czasopismo
Wersja tekstu w otwartym dostępie
Wersja opublikowana
Licencja otwartego dostępu
Creative Commons — Uznanie autorstwa
Czas opublikowania w otwartym dostępie
Razem z publikacją
Data udostępnienia w sposób otwarty
2017-09-08
Streszczenia
Język
angielski
Treść
The T allele of rs7927894 (at 11q13.5) was associated with atopic dermatitis and other allergic diseases. Our purpose was to replicate the association with allergic phenotypes and explore the role of rs7927894 in predisposing to persistent allergic rhinitis and atopic asthma. We also wanted to explore if other SNPs at 11q13.5 contributed to effect of rs7927894. We studied patients with atopic dermatitis (N = 270), atopic asthma (N = 486), persistent allergic rhinitis (N = 589) and controls matched for age, sex and region (N = 540, N = 372 and N = 1178, respectively). We found that rs7927894 T was associated with atopic dermatitis (OR = 1.39, CI: 1.12–1.73, P = 0.003) and independently with persistent allergic rhinitis (OR = 1.24, CI:1.07–1.43, P = 0.0043, Pcorrected = 0.013) but not atopic asthma. Analysis of additional tagging SNPs (rs7930763, rs2513517, rs7125552) showed that effect of rs7927894 T was limited to haplotypes encoding G at rs7125552. In conclusion, rs7927894 T is associated not only with atopic dermatitis but also persistent allergic rhinitis. Since these effects are haplotype dependent rs7927894 alone does not account for the association between 11q13.5 and atopic dermatitis/persistent allergic rhinitis.
Cechy publikacji
artykuł oryginalny
Inne
System-identifier
PX-59e5fa5dd5deb524de423220
CrossrefMetadata from Crossref logo
Cytowania
Liczba prac cytujących tę pracę
Brak danych
Referencje
Liczba prac cytowanych przez tę pracę
Brak danych