Microsatellite mutation rate in Atlantic Sturgeon (Acipenser oxyrinchus).
PBN-AR
Instytucja
Instytut Biochemii i Biofizyki Polskiej Akademii Nauk
Informacje podstawowe
Główny język publikacji
EN
Czasopismo
JOURNAL OF HEREDITY (25pkt w roku publikacji)
ISSN
0022-1503
EISSN
1465-7333
Wydawca
OXFORD UNIV PRESS INC
DOI
URL
Rok publikacji
2017
Numer zeszytu
6
Strony od-do
686–692
Numer tomu
108
Identyfikator DOI
Liczba arkuszy
Słowa kluczowe
EN
Atlantic sturgeon;
microsatellite loci;
mutation rate;
population genetics
Streszczenia
Język
EN
Treść
Understanding mutation rates can greatly extend the utility of population and conservation genetic analyses. Herein, we present an estimate of genome-wide microsatellite mutation rate in Atlantic sturgeon (Acipenser oxyrinchus) based on parent–offspring transmission patterns. We screened 307 individuals for parentage and mutation-rate analysis applying 43 variable markers. Out of 13228 allele transfers, 11 mutations were detected, producing a mutation rate of 8.3 × 10−4 per locus per generation (95% confidence interval: 1.48 × 10−3, 4.15 × 10−4). Single-step mutations predominated and there were trends toward mutations in loci with greater polymorphism and allele length. Two of the detected mutations were most probably cluster mutations, being identified in 12 and 28 sibs, respectively. Finally, we observed evidences of polyploidy based on the sporadic presence of 3 or 4 alleles per locus in the genotyped individuals, supporting previous reports of incomplete diploidization in Atlantic sturgeon.
Inne
System-identifier
PX-59e74e41d5de40fbd4cff025
CrossrefMetadata from Crossref logo
Cytowania
Liczba prac cytujących tę pracę
Brak danych
Referencje
Liczba prac cytowanych przez tę pracę
Brak danych