A model species for agricultural pest genomics: the genome of the Colorado potato beetle, Leptinotarsa decemlineata (Coleoptera: Chrysomelidae).
PBN-AR
Instytucja
Instytut Biochemii i Biofizyki Polskiej Akademii Nauk
Informacje podstawowe
Główny język publikacji
EN
Czasopismo
SCIENTIFIC REPORTS OF THE NATURE PUBLISHING GROUP (40pkt w roku publikacji)
ISSN
2045-2322
EISSN
Wydawca
DOI
URL
Rok publikacji
2018
Numer zeszytu
brak
Strony od-do
1931
Numer tomu
8
Identyfikator DOI
Liczba arkuszy
Słowa kluczowe
EN
S-TRANSFERASE GENES;
RNA-INTERFERENCE;
INSECTICIDE RESISTANCE;
TRANSPOSABLE ELEMENTS;
DROSOPHILA-MELANOGASTER;
GEOGRAPHIC POPULATIONS;
PROTEINASE-INHIBITORS;
TRIBOLIUM-CASTANEUM;
CAENORHABDITIS-ELEGANS;
CYSTEINE PROTEINASES
Open access
Tryb otwartego dostępu
Otwarte czasopismo
Wersja tekstu w otwartym dostępie
Wersja ostateczna autora
Licencja otwartego dostępu
Creative Commons — Uznanie autorstwa
Czas opublikowania w otwartym dostępie
Razem z publikacją
Data udostępnienia w sposób otwarty
Streszczenia
Język
EN
Treść
The Colorado potato beetle is one of the most challenging agricultural pests to manage. It has shown a spectacular ability to adapt to a variety of solanaceaeous plants and variable climates during its global invasion, and, notably, to rapidly evolve insecticide resistance. To examine evidence of rapid evolutionary change, and to understand the genetic basis of herbivory and insecticide resistance, we tested for structural and functional genomic changes relative to other arthropod species using genome sequencing, transcriptomics, and community annotation. Two factors that might facilitate rapid evolutionary change include transposable elements, which comprise at least 17% of the genome and are rapidly evolving compared to other Coleoptera, and high levels of nucleotide diversity in rapidly growing pest populations. Adaptations to plant feeding are evident in gene expansions and differential expression of digestive enzymes in gut tissues, as well as expansions of gustatory receptors for bitter tasting. Surprisingly, the suite of genes involved in insecticide resistance is similar to other beetles. Finally, duplications in the RNAi pathway might explain why Leptinotarsa decemlineata has high sensitivity to dsRNA. The L. decemlineata genome provides opportunities to investigate a broad range of phenotypes and to develop sustainable methods to control this widely successful pest.
Inne
System-identifier
PX-5a9fef0fd5dee740fcde60e4
CrossrefMetadata from Crossref logo
Cytowania
Liczba prac cytujących tę pracę
Brak danych
Referencje
Liczba prac cytowanych przez tę pracę
Brak danych