How many single-nucleotide polymorphisms (SNPs) must be tested in order to prove susceptibility to bacterial meningitis in children? Analysis of 11 SNPs in seven genes involved in the immune response and their effect on the susceptibility to bacterial meningitis in children
PBN-AR
Instytucja
Instytut Genetyki Człowieka Polskiej Akademii Nauk
Informacje podstawowe
Główny język publikacji
angielski
Czasopismo
Innate Immunity (30pkt w roku publikacji)
ISSN
1753-4259
EISSN
1753-4267
Wydawca
SAGE PUBLICATIONS LTD
DOI
URL
Rok publikacji
2018
Numer zeszytu
3
Strony od-do
163-170
Numer tomu
24
Identyfikator DOI
Liczba arkuszy
1
Słowa kluczowe
angielski
Complement
Innate immunity
Meningitis
Meningococci
Pneumococci
Open access
Tryb otwartego dostępu
Otwarte czasopismo
Wersja tekstu w otwartym dostępie
Wersja opublikowana
Licencja otwartego dostępu
Creative Commons — Uznanie autorstwa-Niekomercyjne
Czas opublikowania w otwartym dostępie
Razem z publikacją
Data udostępnienia w sposób otwarty
2018-04-01
Streszczenia
Język
angielski
Treść
The aim of this study is to describe the prevalence of single single-nucleotide polymorphisms (SNPs) as well as their combinations in genes encoding proteins involved in the immune response in children with bacterial meningitis. The prospective study group consisted of 39 children with bacterial meningitis and 49 family members surveyed between 2012 and 2016. Eleven SNPs in five genes involved in immune response were analysed. The mean number of minor frequency alleles (MAF) of studied SNPs was lowest in the control group and highest in patients with pneumococcal meningitis. We found that carrying ≥6 MAF of studied SNPs was associated with an increased risk of pneumococcal meningitis. The prevalence of risky variants was noted to be higher in patients with pneumococcal meningitis as compared to the control group. In conclusion, genetic factors are a relevant factor in determining the susceptibility to bacterial meningitis. A statistically significant cumulative effect of mutated variants on increasing the risk of bacterial meningitis was detected. Combining all three SNPs in MBL2 improves the prediction of susceptibility to pneumococcal meningitis. Analysis of risky alleles can help indicate people prone to the disease who are 'gene-immunocompromised'.
Cechy publikacji
oryginalna
Inne
System-identifier
PX-5acdd4ddd5dea1141b745f15
CrossrefMetadata from Crossref logo
Cytowania
Liczba prac cytujących tę pracę
Brak danych
Referencje
Liczba prac cytowanych przez tę pracę
Brak danych