×

Serwis używa ciasteczek ("cookies") i podobnych technologii m.in. do utrzymania sesji i w celach statystycznych. • Ustawienia przeglądarki dotyczące obsługi ciasteczek można swobodnie zmieniać. • Całkowite zablokowanie zapisu ciasteczek na dysku komputera uniemożliwi logowanie się do serwisu. • Więcej informacji: Polityka cookies OPI PIB

×

Regulamin korzystania z serwisu PBN znajduję się pod adresem: Regulamin serwisu

Szukaj wśród:
Dane publikacji

Enabling Large Scale Individual-Based Modelling through High Performance Computing

Artykuł
Czasopismo : ITM Web of Conferences   Tom: 5, Strony: 1--5
2015-12-11 angielski
Link do publicznie dostępnego pełnego tekstu
Identyfikatory
-
Cechy publikacji
-
  • Oryginalny artykuł naukowy
  • Zrecenzowana naukowo
  • Konferencyjna
  • Indeksowana w Web of Science
Dyscypliny naukowe
-
Biocybernetyka i inżynieria biomedyczna , Biofizyka – dziedzina nauk fizycznych , Informatyka – dziedzina nauk technicznych
Dane konferencji
-
  1. Multiscale and Hybrid Modelling in Cell and Cell Population Biology Workshop on Multiscale and Hybrid Modelling in Cell and Cell Population Biology
  2. 2015-03-16 - 2015-03-18
  3. Paris, Francja
Abstrakty ( angielski )
-
We present a novel large scale parallel computational model allowing 3-D simulations of cell colonies growing and interacting with variable environment. The cells are modelled as individual objects located in the lattice-free 3-D space. The model incorporates cellular environment described in a continuous manner. Discrete and continuous formulations are efficiently coupled in one model allowing considerations of cell colonies composed of up to 10^9 individual cells. This large scale computational approach enables simulations to be carried out over realistic spatial scales up to 1cm3 in size i.e. the tissue scale.
Bibliografia
-
  1. M. Cytowski, Z. Szy,ańska, B. Borucki, A 2-D Large-scale Individual-based model of solid tumour growth, , GAKUTO International Series Mathematical Sciences and Applications, Nonlinear Analysis in Interdisciplinary Sciences 36 , 43-56 (2013)
  2. M. Cytowski, Z. Szymańska, Large Scale Parallel Simulations of 3-D Cell Colony Dynamics, IEEE Computing in Science & Engineering 16 (5), 86-95 (2014)
  3. M. Cytowski, Z. Szymańska, Large Scale Parallel Simulations of 3-D Cell Colony Dynamics. II. Coupling with continuous description of cellular environment, IEEE Computing in Science & Engineering 17 (5), 44-48 (2015)
  4. J. Galle, M. Loeffer, D. Drasdo, Modelling the Effect of Deregulated Proliferation and Apoptosis on the Growth Dynamics of Epithelial Cell Populations In Vitro, Biophysical Journal 88 , 62-75 (2005)
  5. A. H. Baker, R. D. Falgout, T. V. Kolev, U. M. Yang, Scaling hypre’s multigrid solvers to 100,000 cores, in High-Performance Scientific Computing, Eds. M. W. Berry, K. A. Gallivan, E. Gallopoulos, A. Grama, B. Philippe, Y. Saad, and F. Saied, Springer London, 261-279 (2012)
Zacytuj dokument
-