×

Serwis używa ciasteczek ("cookies") i podobnych technologii m.in. do utrzymania sesji i w celach statystycznych. • Ustawienia przeglądarki dotyczące obsługi ciasteczek można swobodnie zmieniać. • Całkowite zablokowanie zapisu ciasteczek na dysku komputera uniemożliwi logowanie się do serwisu. • Więcej informacji: Polityka cookies OPI PIB

×

Regulamin korzystania z serwisu PBN znajduję się pod adresem: Regulamin serwisu

Szukaj wśród:
Dane publikacji

Implementation of an Agent-Based Parallel Tissue Modelling Framework for the Intel MIC Architecture

Artykuł
Czasopismo : Scientific Programming   Tom: 2017, Strony: 1-11
Maciej Cytowski [1] , Zuzanna Szymańska [1] , Piotr Umiński [2] , Grzegorz Andrejczuk [2] , Krzysztof Raszkowski [2]
2017-03 angielski
Link do publicznie dostępnego pełnego tekstu
Identyfikatory
-
Cechy publikacji
-
  • Oryginalny artykuł naukowy
  • Zrecenzowana naukowo
Dyscypliny naukowe
-
Biofizyka – dziedzina nauk biologicznych , Informatyka – dziedzina nauk matematycznych , Informatyka – dziedzina nauk technicznych , Matematyka
Abstrakty ( angielski )
-
Timothy is a novel large scale modelling framework that allows simulating of biological processes involving different cellular colonies growing and interacting with variable environment. Timothy was designed for execution on massively parallel High Performance Computing (HPC) systems. The high parallel scalability of the implementation allows for simulations of up to 10^9 individual cells (i.e., simulations at tissue spatial scales of up to 1 cm3 in size). With the recent advancements of the Timothy model, it has become critical to ensure appropriate performance level on emerging HPC architectures. For instance, the introduction of blood vessels supplying nutrients to the tissue is a very important step towards realistic simulations of complex biological processes, but it greatly increased the computational complexity of the model. In this paper, we describe the process of modernization of the application in order to achieve high computational performance on HPC hybrid systems based on modern Intel® MIC architecture. Experimental results on the Intel Xeon Phi™ coprocessor x100 and the Intel Xeon Phi processor x200 are presented.
Pełny tekst
-
  1. Rodzaj tekstu: Pierwotna wersja autorska
  2. Licencja: Creative Commons BY 3.0 PL
  3. Pliki
    1. 8721612.pdf, 2 903 kB Pobierz plik
Zacytuj dokument
-